光绪十年(1884)，法舰发动突然袭击马尾前二月，何如璋已看到问题的严重，曾经两次向清廷上奏《法船聚泊马江应亟调兵船赴援协防折》和《法船聚泊马江请调南北洋兵轮以相牵制折》，提出“应集中兵力，先发制人，后发即为人制”的战略，和“清旨饬下南北洋大臣，迅派各快船，克期赴闽，以助支援……”等建议。但清廷掌实权的慈禧，只知求和，对何如璋奏折不接受，以致马尾船厂遭法舰的突然袭击而手足无措，以惨败告终。何如璋因受牵连，遭革职。清廷为了推卸其罪责，曾派左宗棠“饬查马江失事一案事各员”。经左宗棠认真查实后，认为对何如璋的处理应该“既经革职，可否邀恩免议”。结果，朝廷还是将他贬戍军台三年。在戍期间，他著有《管子释疑》36卷。军台放还后，他退出官场，受聘韩山书院讲席。光绪十七年(1891)，病卒于韩山书院。终年54岁。

　　何如璋公私分明，严于律己，主马尾船政期间，不少子侄致函给他，要求谋职，何如璋都婉言劝止。他担任福建船政大臣时，给父母的信中说：“船政系办公之地，亦无督办到署，即行任用本家亲戚，迹涉营私之事。……转致各本家亲戚，不宜冒昧前来，彼此岂无趣味也。”(见何如璋光绪九年(1883)十一月二十九日致双亲书)。何如璋极重友情，驻日期间，与日人得能良介相交频深，良介将外甥樽原陈政托何如璋教养，何如璋不负友人所托，任满后还把樽原陈政带回中国，樽原陈政长大后，任日本驻北京使馆参赞，闻何如璋卒，千里迢迢到何如璋老家，拜谒何如璋夫人，还到何如璋坟上致吊，涕泪交流，还雕了两只石狮子，安放在何如璋墓前，以答谢何如璋教育之恩。

　　何如璋著有《使东述略》、《使东杂咏》、《使日函牍》、《管子析疑》36卷和《塞上秋怀》、《袖海楼诗钞》等诗文。

主要成就

　　收回领事裁判权

　　在日本后所做的第一件大事是收回领事裁判权。

　　何如璋到日本时，正值台湾劫杀琉球渔民事件发生后不久。日本以这一事件为发端，冒称琉球系其属国，策划征伐台湾，清廷为求息事，赔以军费计白银50万两。日本执政者越发得逞，议废除居留华民旧规，取消横滨，神户和长崎的领事裁判权。何如璋到任后，援引国际公约，与日方反复交涉，终于达成协议，除在东京设公使馆外，在横滨、神户、长崎三城市设领事馆，并收回领事裁判权。此举使侨胞的生命财产得到合法保障，使侨胞备受歧视凌辱的状况得到很大改善，至今日本华侨对何如璋仍深怀敬意，对何如璋据理力争收回领事裁判权津津乐道。