这时候，有人向昭宗密报杨复恭同杨守信合谋造反。昭宗正在等待最有利的时机，他把以往搜集到的杨复恭的罪证连同谋反的消息一同公布，派李顺节等人带兵前去逮捕杨复恭。杨复恭令其家人抗拒官兵，杨守信也带兵前来助战，双方发生大战，从白天一直打到深夜。这时，守卫城门的禁军想趁乱打劫，昭宗对此早有准备，命令宰相刘崇望率领人马守护财物，防止有人抢劫。刘崇望看到禁军要抢劫，斥责道：“皇帝正在亲自督战，你们都是皇帝的宿卫之士，应当前去杀贼立功，而不是趁火打劫。”众军士都表示愿意听命，跟着刘崇望前去助战。杨复恭看到刘崇望带兵增援，自料难以继续对抗下去，于是带领全家出逃，直奔兴元。杨复恭到兴元后，纠集兵力，向朝廷开战，昭宗也借助各地节度使的力量与之对抗。经过一年多的战斗，杨复恭的军队被节度使李茂贞打败。最终，杨复恭在逃亡的途中被捉，当即被斩首。

　　杨复恭出逃后，李顺节也失去了利用价值，被昭宗纳入了铲除的名单之中。昭宗命令两军中尉铲除李顺节。两军中尉以昭宗的名义诏李顺节入宫，李顺节带三百士兵来到宫门，宫门侍卫拦住随行军士，只让李顺节一人进宫。李顺节一进宫，即被埋伏的士兵所杀。

　　经过一系列斗争，昭宗初步掌握了权力，狠狠打击了多年以来宦官骄横跋扈的状况，使宦官势力多年来第一次遭受重创。但是在打击宦官势力的过程中，另一个令昭宗头痛的难题又出现了，这就是越来越庞大的藩镇势力。

　　昭宗时，藩镇势力已成尾大不掉之势。面对这种情况，昭宗认识到皇室微弱的主要原因是没有一支足够震慑诸侯的武装力量，所以藩镇才各自拥兵，目无天子。僖宗时，中央禁军已经被彻底摧毁。因此，昭宗即位后不久，便招兵买马，扩充禁军，得十万之众，“欲以武功胜天下。”在禁军初建后，昭宗便开始了对藩镇的斗争。

　　文德元年（888）十二月二十四日，昭宗任命韦昭度为行营招讨使，率兵出征，令山南西道节度使杨守亮、东川节度使顾彦朗助讨，同时新设永平军，以王建为节度使，充行营诸军都指挥使。二十五日，下诏剥夺陈敬瑄官爵，伐西川之役就这样拉开了序幕。