张同敞平时十分敬重瞿式耜，立即泅水过江，赶到留守衙门，见瞿式耜说：”形势这么危急，你怎么办?”瞿式耜说，”我是留守，有责任守好这地方，‘城存与，城亡与亡’。今天，为国家而死，死得光明磊落。你不是留守，为什么不走”。张同敞听了说：”要死，就一起死，老师，你难道不允许我和你一起殉难吗？”就在旁边椅子上坐下来，和瞿式耜一起饮酒。东方渐渐发白，清兵冲进衙门，要捆绑他们。瞿式耜说：”我们不怕死，坐等一夜了，用不着捆绑。”和张同敞昂首阔步走出衙门。

　　这次攻陷桂林的是清定南王孔有德，是原明朝登州守将。他一心想收降瞿式耜。曾写信劝降，瞿式耜”焚书斩使”，作了明确答复。这次听到瞿式耜被俘，很高兴，看到瞿式耜进来，赞叹着说：”你是瞿阁部吗？好阁部！”瞿式耜笑笑说：”你是王子吗？好王子！”。孔有德还是劝降，反复引譬，都被瞿式耜严词拒绝。孔不认识张同敞，要他跪。张同敞不跪，反而揭孔有德的老底，破口大骂。孔恼羞成怒，打张同敞耳光；手下的卫士，有的揿张同敞颈椎骨，要他低头；有的用刀背敲张同敞膝骨，要他下跪。臂骨被打折，一只眼睛被打瞎。瞿式耜看到这种暴行，遏制不住心头愤怒，挺身遮住张同敞大声说：”这是总督张同敞，是国家大臣，他和我一样抱定为国牺牲的决心，要死，我们一起死，不得无礼！”

　　孔有德知道一时无法劝说，命令把两人囚禁在风洞山（今称叠彩山）临时监狱里。关在不同的房间，但允许二人互通消息，以图徐徐劝降。同时，他还派人送去精美食物，但都被两个人掀翻在地，斥为”猪狗食物”，直到送饭人换成了一个前明的礼部主事方才罢手。

　　瞿式耜在囚室里，孔有德仍然不止一次地派人劝降，都被拒绝。后来，孔有德降低了希望，提出只要二人剃发为僧即可免于一死也被严词拒绝。瞿式耜被囚中他写了不少诗，反映了坚贞不屈的民族气节以及忠贞不渝，为国献身的精神，

　　关押期间与张同敞诗歌唱和，后来汇编为《浩气吟》，其中式耜的两句是这样写的：”莫笑老夫轻一死，汗青留取姓名香。”张同敞则回应：”衣冠不改生前制，名姓空留死后诗。”