1952年，胡先骕积极参加了反对美国发动细菌战的研究工作。经他鉴定，美国侵略者投下的沾有病菌的松树枝叶等植物均系分布于南朝鲜，而不是分布在中国东北和朝鲜北部的植物。由于在这项工作中成绩卓著，曾荣获第二届中国卫生会议模范奖状和奖章。

　　1953年胡先骕应邀编写了一部《经济植物学》。该书除花卉、森林和药用植物外，凡中国所有或在中国能见到的其他引进的经济植物，书中均作了详细记载，对各种经济植物的利用也有介绍。该书至今仍有它的重要参考价值。

　　1952年暑期中国院系调整后，北京师范大学另迁新址。胡先骕因忙于科研任务，是年秋季便告别了数十年的教育与教学生活。胡先骕对中国植物学的研究，尤其是对植物分类学、古植物学和经济植物学的研究与教学，取得了突出的成就，先后发现一个新科、十个新属、数百个新种。

人物评价

　　胡先骕自青年时代就怀着科学救国的宏愿，数十年来为发展祖国的科学事业，高瞻远瞩、苦心孤诣。在长期的教学工作中，除亲自传授植物分类学、经济植物学等教学任务外，还为青年编写具有较高水平的教科书、植物学教学法和学习指导等著述。他在授课过程中，虽然稍带口吃，但声音洪亮，精力充沛，内容也极为充实，特别强调实验课和深入实际的重要性。（《中国新闻周刊》杨丽娟评）

　　回忆先师，备觉其形象高大，气质宏伟。胡师思想深邃，著作等身，一生共发表论文150余篇，发表新种200多个，出版书籍20余部，培养了大批植物学人才。他还是精通古诗词的文学家，曾参加过多次文学论战而蜚声文坛。在讲学期间，胡师屡屡谈及人生，曾深情地说：每个人一生都会遇到艰难曲折、急流险滩，企图一世平安顺利，那是不现实的幻想；问题是要学会对付困境逆境，顺其自然，泰然处之。他的哲理是：正直、理智和无畏。胡师总是以哲学家的理念、科学家的智慧和诗人的情怀去体验变幻不定的人生!（南昌大学生物系教授邓宗觉评）

　　有人说，他是“开创者”。因为他是中国植物分类学的奠基者，是中国近代生物学的开创人，是享有世界声誉的植物学家，曾被毛泽东同志称赞为“中国生物学界的老祖宗”；也有人说，他是“守旧派”。因为他曾作为《学衡》主将，与当时提倡新文化运动、全盘否定传统文化的胡适等人大开笔战，共同书写了20世纪文化史上省略不了的一页；还有人亲切地称他为“江西的老校长”。他曾在抗日战争最为激烈的1940年，回乡创办江西第一所综合性大学—中正大学，以其巨大的人格魅力，约请了一大批在外的江西学者回归乡梓，设坛讲学，培育了一大批人才。无论人们如何评说，无论胡先骕具有怎样多重的身份，无论他曾在20世纪中国文化史上扮演过怎样的角色，都不能影响他的当之无愧的身份—大师。