不久，高允以本官任秦王拓跋翰的老师。后又命他教授太子拓跋晃经书，受到了很好的礼遇。太武帝又诏高允与侍郎公孙质、李虚、胡方回一同议定律令。太武帝召高允一起讨论刑政，高允的言论很得太武帝赏识。太武帝问高允说：“政事千头万绪，什么是第一位的？”当时，北魏多禁封良田，京城中游民很多。高允因此说：“臣少时微贱，所了解的只有田耕之事，请让臣说一说农事。古人说：一里方圆的范围可以辟田三顷七十亩，百里方圆则有田三万七千顷。如果农人勤耕，则每亩可增粮三斗，不勤则损失三斗。方圆百里增加减少的数量，合计有粮二百二十二万斛，何况天下如此之广呢？如若公私都有粮食储备，即使遇上荒年，那又有什么可忧虑的呢？”太武帝很欣赏他的说法。于是废除田禁，全部把它们交给老百姓。

　　先见之明

　　当初，崔浩推荐冀、定、相、幽、并五州之士数十人，每人都当郡守。拓跋晃对崔浩说：“先召的人，也是州郡官职的人选，在职已久，勤劳政事未见酬答。现今可先补前番征召的人为郡县守令，以新召的人代为郎吏。而且太守县令治理百姓，应该派那些有经验的人。”崔浩坚决不让步，固执地派了那些新征召的人。高允听说此事，对东宫博士管恬说：“崔公要遭殃了！坚持自己的错误，而要与太子争个高低，这哪会有什么好结果。”

　　辽东公翟黑子得到太武帝的宠信，出使并州，得到了千匹绢帛的贿赂，不久事发。翟黑子向高允请教说：“主上问我，是汇报真实情况还是说假话？”高允说：“公是皇上宠臣，回答时可据实以报，你又可自表忠诚，必然会没什么事的。”中书侍郎崔览、公孙质等人都说自首后罪不可测，应该说假话。翟黑子以崔览等人为知己，反而对高允发脾气说：“你的说法，是引诱我去死，那太不值得了！”于是与高允断交。翟黑子在太武帝面前说了假话，终被太武帝疏远，最终获罪被杀。

　　当时，著作令史闵湛、郄扌剽性情奸巧邪佞，被崔浩所信任。见到崔浩所注释的《诗》、《论语》、《尚书》、《易》，便上疏，说马、郑、王、贾虽然注述《六经》，都多有疏漏谬妄，不如崔浩的精到细微。请求太武帝收集国内诸书，藏于秘书府中。颁发崔浩所注述的，命天下学子学习。并请求太武帝下诏让崔浩注释《礼传》，让后生能够看到精正的经义。崔浩也上表推荐说闵湛有著述的才能。接着闵湛等劝崔浩刊印自己所撰的国史，以图不朽，想要彰明崔浩执笔之绩。高允听说，对著作郎宗钦说：“闵湛的所作所为，一不小心，我担心它日后会成为崔门的万世灾祸。这样我们这些曾经参与其事的人都要大祸临头了。”不久，灾难就降临了。