喇嘛时期

　　在布达拉宫，仓央嘉措受到严格监督学经修道，他常走出庭院散心，而那些年老的经师则亦步亦趋地跟随着他，恳求他继续学经，生怕被第巴责骂。仓央嘉措出身红教家庭，红教教规并不禁止僧侣娶妻生子，而黄教则严禁僧侣接近女色，更不能结婚成家。对于种种清规戒律繁文缛节，仓央嘉措难以适应。

　　仓央嘉措虽有达赖喇嘛之名，却并无实权。第巴独掌大权已久，达赖喇嘛只能作为傀儡存在。生活上遭到禁锢，政治上受人摆布，仓央嘉措内心抑郁，索性纵情声色，这既出于他对自由与爱情的向往，也是他对强加的戒律和权谋的故意反叛。就像他那首著名的诗歌写的：“住进布达拉宫，我是雪域最大的王。流浪在拉萨街头，我是世间最美的情郎。”据传说记载，他一到晚上就化名达桑旺波，以贵族公子的身份，流连于拉萨街头的酒家、民居，再后来，竟“身穿绸缎便装，手戴戒指，头蓄长发，醉心于歌舞游宴，夜宿于宫外女子之家。”

　　政治冲突

　　此时的西藏，政局动荡，政治矛盾已到达了极其尖锐的时期。早在明末清初，黄教为取得西藏统治权，联合蒙古四部之一的和硕特部，用武力击败了当时执政西藏的藏巴汗及噶玛噶举派。但和硕特部军队在西藏取得胜利后，长期屯驻当地不退，黄教与和硕特部实力悬殊，始终不能夺回大权。五世达赖圆寂后，桑结嘉措便开始了与和硕特汗王的斗争。如今的一些藏族历史研究者认为，桑结嘉措受到历代诟病的行为，都是为了击败和硕特部以获得民族自治，比如密不发丧，以五世达赖名义向清政府请封为王，借助准噶尔军事力量等等，不能简单地视作个人篡权阴谋。

　　康熙四十年（1701年），固始汗的曾孙拉藏汗继承汗位，与第巴（即藏王）桑结嘉措的矛盾日益尖锐。

　　康熙四十四年（1705年），桑结嘉措终于决定先下手为强，他秘密派人在和硕特首领拉藏汗的饭中下毒，却被发现，拉藏汗大怒，立刻调集大军击溃藏军，杀死桑结嘉措，并致书清政府，奏报桑结嘉措谋反，又报告说桑结嘉措所立的六世达赖仓央嘉措沉溺酒色，不理教务，不是真正的达赖，请予贬废。康熙皇帝于是下旨：“拉藏汗因奏废桑结所立六世达赖，诏送京师。”